Terminal kolejowy zlokalizowany na terenie Bałtyckiego Terminala Kontenerowego (BCT) stanowi część infrastruktury kolejowej zarządzanej przez Zarząd Morskiego Portu Gdynia S.A.
Układ torowy BCT dzieli się na układ zewnętrzny i wewnętrzny. Układ zewnętrzny obejmuje obecnie siedem torów manewrowo-postojowych wyposażonych w system automatycznego sterowania ruchem kolejowym (SRK). Układ wewnętrzny obejmuje trzy tory ładunkowe przeznaczone do obsługi przeładunków kontenerów oraz dwa tory przeznaczone do obsługi wagonów z ładunkami drobnicowymi.
Pełny wykaz parametrów technicznych torów zawiera Regulamin Bocznicy Kolejowej Zarządu Morskiego Portu Gdynia S.A., dostępny na stronie internetowej Zarządu Morskiego Portu Gdynia: https://www.port.gdynia.pl/pl/dla-kolei.
Dostęp do torów ładunkowych BCT oraz zasady prowadzenia ruchu kolejowego regulują następujące dokumenty: Regulamin Bocznicy Kolejowej Zarządu Morskiego Portu Gdynia S.A., Regulamin dostępu do OIU oraz Zasady prowadzenia ruchu kolejowego i sygnalizacji na infrastrukturze Zarządu Morskiego Portu Gdynia S.A. Dokumenty te są dostępne na stronie internetowej Zarządu Morskiego Portu Gdynia: https://www.port.gdynia.pl/pl/dla-kolei.
Zasady awizacji pociągów kierowanych do obsługi w BCT oraz reguły współpracy pomiędzy operatorami kolejowymi, obsługującymi ich przewoźnikami kolejowymi a BCT określają dokumenty: Usługi Terminalowe – Standardowe Warunki Handlowe, załącznik A – Regulamin Operacyjny, część III – Lądowe Operacje Przeładunkowe, punkt C – Obsługa wagonów, a także Taryfa BCT. Dokumenty te są dostępne na stronie internetowej BCT w sekcji Ogólne warunki handlowe.
Od 1 lutego 2021 r. w BCT funkcjonuje platforma komunikacyjna INCOS, za pośrednictwem której obowiązkowo dokonuje się elektronicznej awizacji składów wagonowych kierowanych do obsługi w terminalu. Platforma jest dostępna pod adresem: https://www.incos.pl/incos/login.